Весь мир сочувствует героям мультфильма «Мутанты — Черепашки-ниндзя: Новые приключения» — они некрасивы, но добры и обаятельны. Кроме того, Рафаэль, Леонардо, Донателло и Микеланджело всегда готовы бороться со злом. В сериале они вновь демонстрируют чудеса смелости и ловкости. На их стороне мудрый наставник сэнсэй Сплинтер.
Когда Эйприл О'Нил становится жертвой нападения мышелотов Бакстера Стокмана, ей на помощь приходят Черепашки-ниндзя. Эйприл становится их другом. Чуть позже на экране появляется еще один персонаж — Кейси Джонс, ночной мститель в маске. Четверым отважным друзьям предстоит услышать истории подземелья, пережить атаки Шреддера и победить всех своих врагов.
Над сценарием сериала работали Кевин Истман, Питер Лэрд, Кевин Манро.
