Фильм рассказывает о раскрытии дела о пропавших без вести гражданах-хищниках крольчихой-сотрудником полиции и лисом-мошенником в городе животных Зверополисе.
Как и любой мегаполис, Зверополис разделен на районы, причём каждый из них полностью повторяет естественную среду обитания его жителей. Животные в мире Зверополиса когда-то были дикими, но ко времени, когда происходит действие фильма, люди так и не появились, а диких животных уже не существует.
