Действие фильма происходит через 300 лет после Великой войны в 26 веке. Доктор Идо находит останки женщины-киборга. После ремонта Алита ничего не помнит, но обнаруживает, что владеет различными боевыми приемами. Начинаются поиски утраченных воспоминаний.
