Действие фильма происходит через 300 лет после Великой войны в XXVI веке. Доктор Идо находит останки женщины-киборга. После починки Алита ничего не помнит, но обнаруживает, что владеет различными боевыми приемами. Начинаются поиски утерянных воспоминаний.
