Однажды человечество оказалось на грани гибели из-за злого учёного Доктора Хелла и его подпольной империи. Кодзи Кабуто, его супер-робот Мазингер Зет и их друзья из Лаборатории фотонной энергии положили конец разрушительным амбициям Хелла и вернули человечеству мир.
Прошло 10 лет. Кодзи пошёл по стопам своего отца и дедушки и стал учёным. В процессе работы он сталкивается с неизвестной доселе формой жизни, захороненной глубоко под горой Фудзи. Новая встреча, новая угроза и новая судьба ждут человечество, будущее которого вновь доверено Мазингеру Зет.
