Более 4000 лет назад человечество покинуло колыбель своей цивилизации, планету Земля. Осваивая просторы вселенной, человеческий род процветал и в полной мере использовать все технологии. Люди научились выживать в сложных условиях космоса, создали Киборгов и впоследствии Андроидов, научились совершать квантовые скачки в пространстве.
Однако, борясь за выживание, человеческой цивилизации приходится сталкиваться с враждебными инопланетными Гнозис. Человечество пытаются найти способы, чтобы победить эту угрозу. Создание инженером Сион Удзуки специализированного Андроида с удивительными возможностями по имени КОС-МОС стало одним из ответов на угрозу. Однако в сражении корабль разрушают Гнозис, Сион и её спутники оказываются в центре сражения.
