Аска Лэнгли Шикинами и Мари Прославленный Макинами, пилоты Евы-02 и Евы-08, после боя захватывают контейнер на низкой околоземной орбите, в котором запечатаны Ева-01 и Синдзи, после чего Аска доставляет контейнер на Землю. Неизвестные освобождают Синдзи из Евы-01 и выводят его из комы, после чего надевают ему на шею специальный ошейник, который должен помешать мальчику разбудить Еву-01, уничтожив его при этом. Среди незнакомцев Икари встречает Мисато Кацураги, Аску и Рицуко Акаги. Все они относятся к нему холодно, давая понять, что не нуждаются в его помощи. Синдзи требует объяснений, но в это время корабль, на котором он находится, подвергается нападению.
