Аска Лэнгли Сикинами и Мари Илластриэс Макинами, пилоты Ева-02 и Ева-08, после боя захватывают на околоземной орбите контейнер, в котором запечатаны Ева-01 и Синдзи, после чего Аска доставляет контейнер на Землю. Неизвестные люди освобождают Синдзи из Евы-01 и выводят из комы, после чего надевают ему на шею специальный ошейник, который должен помешать мальчику пробудить Еву-01, уничтожив его при этом. Среди незнакомцев Икари встречает Мисато Кацураги, Аску и Рицуко Акаги. Все они обращаются с ним холодно, давая понять, что не нуждаются в его помощи. Синдзи требует объяснений, но в это время корабль, на котором он находится, подвергается атаке.
