Воздушный флот WILLE успешно проводит парижскую операцию: отбивается от армии беспилотных роботов, активирует гигантский запечатывающий столб, восстанавливает город и приобретает боеприпасы и запчасти для Евангелионов. Тем временем Синдзи, потерявший волю к жизни из-за смерти Каору и Четвертого удара, который он сам едва не вызвал, послушно следует за Аской вместе с Рей, и вскоре троица оказывается в Третьей Деревне — восстановленное поселение, где люди пытаются наладить мирную жизнь.
