Действие происходит в 24 веке. Человечество колонизирует многие планеты. На планете Соло, в галактике Андромеды группа археологов находит груз с таинственными механизмами, оставленными неизвестной цивилизацией. Эти механизмы могут трансформироваться в меха-роботов Идеонов.
Через 6 месяцев, люди реставрируют машины и пытаются активировать роботов. Внезапно появляются представители инопланетной человеческой цивилизации, известные, как Бафф. Карала, дочь военного командира бафф вместе с помощником Маяей совершает посадку на Соло, корабль бафф следящий за ней, теряет Каралу из вида и решает, что на неё напали люди. Так бафф объявляют войну человечеству. Молодой парень Космо Юки и его друзья Каша Имхоф и Дек Афта начинают пилотировать три машины Идеона, чтобы защищать человечество. Бафф имеют также цель заполучить машины Идеона, которые они называют «боги-машины».
