Через 35 лет после событий первой части противостояние мегакорпораций и мирового правительства лишь стало ожесточеннее. Тем временем лучшие умы человечества отменяют Эйнштейна и делают возможным Сверхсветовой Двигатель. Спонсирует это торжество разума корпорация TriOptimum, и вскоре создаёт принципиально новый космический корабль. А для контроля со стороны правительства к кораблю приставляют эсминец «Риккенбекер».
Главным персонажем является безымянный солдат с «Риккенбекера», который через месяц после первой высадки на Тау Кита просыпается от криосна с головной болью, полным телом запрещённых кибер-имплантатов и отсутствием каких-либо воспоминаний.
