Игра начинается в школе Seven Sisters High города Сумару от лица школьника Тацуи Суо. В это время по школе ходит слух о неком Джокере — исполнителе желаний, которого можно вызвать звонком по телефону. В итоге Джокер был вызван, но вместо того, чтобы исполнять желания, он начинает убивать людей по всему городу. Помимо этого в городе начинает действовать оккультная секта Маскарад. Спасти город предстоит Тацуе и его друзьям, которые имеют Персоны, дарованные Филемоном — существом, следящим за балансом между порядком и хаосом в мире.
