Эксцентричная бизнес-леди Жаклин Натла нанимает Лару Крофт для поисков древнего артефакта Сциона. Археолог отправляется в горную экспедицию в Перу, где находит потайной вход в жилище инков. Проводник Лары погибает от атаки волков, и дальше ей приходится идти одной. В глубине заснеженных пещер она находит Вилкабамбу — «город в скале», где, по преданию, похоронен царь Квалопек. Его гробница — и есть местонахождение Сциона. На выходе из гробницы Лару встречает другой наёмник Натлы — Ларсон. От него Лара узнаёт о том, что найденный артефакт — лишь составная часть ключа к воротам Атлантиды. Лара отправляется в офис Натлы, где узнает о местонахождении недостающего кусочка.
