Игра начнется с бури, в которую попадает корабль Принца Персии во время путешествия на остров Времени. Герой смог выжить, но потерял свое оружие, своих людей и свой корабль. Поэтому, дальнейшее приключение Принц начинает в одиночестве.
Ему предстоит найти Императрицу и предотвратить создание Песков Времени, для этого Принц пройдет через прошлое и настоящее Острова, избежит сотен смертельных ловушек и сразится с ордами врагов, в том числе и с бессмертным Дахакой.
