В 2006 году вышла третья, заключительная, часть ролевой игры Xenosaga под названием Xenosaga Episode III: Also sprach Zarathustra, разработанная компанией Namco Bandai Games America.
По сюжету третьей части Xenosaga Episode III: Also sprach Zarathustra мы продолжаем действия предыдущих двух частей саги. Федерация галактики не может противостоять захватчикам, которые почти невидимы нашему зрению, и наше обычное оружие их не поражает. Корпорация «Вектор», занимающаяся новыми технологиями, обещала Федерации покончить с агрессорами при помощи боевых роботов, умеющих самостоятельно отыскивать и ликвидировать чуждые существа. Корпорация погрязла в махинациях, и ее ученые параллельно стали разрабатывать киборгов, способных уничтожить пришельцев.
