Вскоре после событий Super Robot Wars Alpha Федерация Земли скрыла большую часть сведений о сражении с Аэрогейтерами, но гравитационный удар от взрыва в Эксельсиона космосе стремительно приближается к Земле, угрожая уничтожить и колонии, и жизнь на планете. Единственная надежда человечества — система «Аэгис», способная защитить Земную сферу от ударной волны…
