Действие происходит в Италии в 1943 году сразу после событий игры Sniper Elite III. Узнав о новом нацистском оружии, Королевский Военно-Морской Флот посылает транспортник «Орхидею» на остров Сан-Селини для расследования. Корабль был быстро потоплен новым оружием — радиоуправляемой противокорабельной ракетой — изобретением учёного Андреаса Кесслера и Хайнца Бёма, высокопоставленного немецкого генерала, о котором союзники имеют мало информации.
Снайпера УСС Карла Фейрберна посылают на остров после катастрофы с поручением убить генерала Тобиаса Шмидта вместе с несколькими другими офицерами, которые курировали атаку.
