Действия игры происходят в регионе Утаката в период гражданской войны. Игроку предлагается пройти путь ниндзя по имени Зен. Он был предан союзниками и остался без крыши над головой. Его спасли люди клана Асука. С тех самых пор Зен посвятил свою жизнь великому искусству ниндзя. Зен хотел воздать по заслугам тем, кто разрушил его жизнь. Он активно занимался их поисками, и теперь они увенчались успехом.
