Экшен Rogue Trooper показывает, какой может быть война в будущие времена. После многолетних военных противостояний между Югом и Севером затерянная где-то на просторах космоса планета Nu Earth стала сплошным выжженным радиоактивным адом, в котором бессмысленная война по-прежнему продолжается, а Север и Юг противостоят друг другу. Однако по ходу сюжета в игре Rogue Trooper мы узнаём о существующей легенде о таинственном бойце, не принадлежащим ни к одной, ни к другой стороне и нападающем на любого, кто повстречается на его пути. О нём известно только лишь то, что он является тем самым единственным выжившим солдатом из специального подразделения GI.
Игрок в Rogue Trooper участвует во многих боях, что идут на этой планете. У главного героя имеется в наличии сверхтехнологичное снаряжение: шлем, способный спроецировать голограмму для отвлечения внимания, винтовка, работающая как автоматический турель, и рюкзак для оказания медицинской помощи. Игроку предоставляется выбор тактики ведения боя.
