Ninja Gaiden 3: The Ancient Ship of Doom

Действие игры разворачивается между первой и второй частями. Неизвестный, выдававший себя за Рю Хаябусу, убивает агента ЦРУ Ирен. Настоящий же Рю потрясен этой новостью и отправляется на поиски убийцы.