На хиигарцев надвигается новая угроза. Воинственные вэйгры желают захватить всю галактику. Как и прежде, игрок управляет огромным кораблём-маткой — в этот раз «Гордостью Хиигары». «Гордость Хиигары» вовсе не тот же материнский корабль из первой части, — это более совершенное судно второго поколения. Роль командного ядра корабля снова выполняет Каран С’джет. Экипажу «Гордости Хиигары» предстоит путешествовать в неизведанные регионы галактики, вступая в бои с новым противником, чтобы найти спасение для их расы…
