Действие Guilty Gear происходит в мире будущего, около 2180 года. В начале XXI века люди начали исследовать магию и обнаружили, что она является источником энергии невероятной мощи. Вскоре была открыта возможность трансформировать биологические объекты, как людей, так и животных, с помощью магии, превращая их в так называемые Механизмы.
После трансформации большинство Механизмов утрачивало свободу воли, что делало их полностью зависимыми от воли Механизма командного типа. После того, как лидером Механизмов стала Джастис, чьей единственной целью было уничтожение людей, подчинённые ей Механизмы обратились против человечества, начав столетнюю мировую войну, получившую название Крестовые походы.
