Российский учёный Владимир Нехорвич, работавший в компании Biocite Farmaceutical, разработал новый препарат, лечащий грипп. В ходе испытаний для лабораторных целей был создан новый вирус гриппа, на котором было проверено лекарство. Это оказалось опасное биологическое оружие, которое Нехорвич назвал «химерой». Антивирус назывался «Беллерофон».
Коррумпированный руководитель Biocite Farmaceutical Джон Макклой вступил в сговор с бывшим сотрудником МВФ Шоном Эмброузом с целью продать «химеру». Итан Хант должен остановить преступника. В помощь ему и его команде дают Наю Нордофф-Холл, профессиональную воровку, с которой у Эмброуза ранее был роман.
