Мир сериала похож на современную Японию, но есть и некоторые отличия. Так, например, главный герой живет в «студенческом городке», где 80% жителей — студенты (из общей численности населения в 2,3 миллиона человек). Экстрасенсорные способности признаны наукой и являются довольно распространенным явлением; по степени владения людьми делятся на категории: от уровня 0 (невозможность использования своих способностей) до уровня 5 (высшие способности). Магия, напротив, официально не признана.
Камидзё Тома — ученик средней школы. У него нет экстрасенсорных способностей, и он не верит в магию и тому подобное. Однако его правая рука имеет необычную особенность: она нейтрализует все психическое и магическое, к чему прикасается. Однажды, проснувшись утром, Тома обнаружил висящую на перилах балкона девушку в одежде, напоминающей одеяние монахини. Девушка рассказала, что ее зовут Индекс, и что в ее памяти хранятся 103 тысячи запрещенных церковью магических книг. А еще, что за ней и ее памятью охотятся маги. Тома ей сначала не поверил, но, как вскоре выяснилось, сказанное было не так уж далеко от истины...
