История начинается 28 июля 2010 года в Акихабаре, когда студент Токийского университета Ринтаро Окабе находит тело Курису Макисе, одного из участников, в луже крови в здании Радио Кайкан, где проходила конференция о путешествиях во времени. В панике он отправляет своему другу электронное письмо о том, что произошло. Однако уже через несколько часов он встречает Курису, спасение которого каким-то образом связано с тем самым письмом, которое, как позже узнают главные герои, изменило прошлое.
