Игрок управляет действиями бывшего бойца SAS Дэвида Джонса, ныне работающего в операции под кодовым словом I.G.I (I'm Going In — «Я вхожу»). Ему своими указаниями из Центра помогает Аня — специалист в области компьютерных систем и ядерной физики.
В начале игры Джонса забрасывают в тыл врага, на территорию России, где он попадает на военный объект, принадлежащий некому Иосифу Прибою, возможно причастному к похищению ядерной бомбы.
