Человек-Паук преследует Песочного Человека через весь Нью-Йорк. Они сражаются друг с другом и Песочный Человек терпит поражение, как раз перед тем как Носорог бросает машину в Человека-Паука, и убегает. Носорогу удается бежать, а затем Трискелион можно увидеть в огне. На протяжении всей игры Человек-паук должен бороться с несколькими злодеями, которые появляются в серии комиксов Ultimate Spider-Man: Электро, Зеленый Гоблин и Носорог.
