Действие игры происходит в вымышленной вселенной серии игр Front Mission в 2127 году, между событиями игр Front Mission 5 и Front Mission Evolved; её местом действия является охваченный войной российский город на территории «Республики Зафтра».
В Left Alive присутствуют трое главных героев, которые действуют независимо друг от друга; в течение игры игрок может переключаться между ними. Мир игры не является бесшовным и состоит из отдельных уровней. В течение большей части игры игрок управляет персонажем-человеком, хотя в игру также включены поездки на характерных для вселенной Front Mission шагающих боевых машинах — «ванзерах».
