Blackgate — это тюрьма, в которой разворачиваются события после «Летописи Аркхема», когда преступники опять вырвались на свободу. Игра разделена на три сектора, в которых власть захватили Джокер, Пингвин и Чёрная маска, представляя реальную угрозу для Бэтмена, по сравнению с их приспешниками и заключенными. Почти каждый из секторов обладает своим секретом или скрытым проходом, который должен быть обязательно найден для дальнейшего прохождения.
