После событий Prince of Persia (2008) Принц и Элика разделяются. В то время, как Элика остаётся с Ахурами, сражаясь с Ахриманом, Принц отправляется на поиски царя города Новая Заря, в надежде, что он может вызвать Ормузда.
В своём опасном путешествии он находит себе нового союзника — мага Зала, который был затронут Искажением. Из-за этого он может управлять Искажением, но также периодически оно захватывает его разум. Герои объединяются, чтобы спасти королевство от искажения и, в конечном счёте, остановить Ахримана.
