Действие игры Vagrant Story разворачивается в Валендии, фантастической стране, во времена Средневековья, а также в древнем, почти полностью уже разрушенном городе Леа Моде.
Главный и единственный игровой персонаж в Vagrant Story — спецагент правительственной службы Эшли Риот — получает задание проникнуть в таинственный город, дабы выяснить, существует ли связь между могущественным членом парламента герцогом Бардорбой и находящейся в этих руинах сектой Мюлленкамп. Внезапно он начинает ощущать на себе зловещие силы города.
